Le shérif Rick Grimes se réveille à l'hôpital après un long coma. Il découvre avec effarement que le monde, ravagé par une épidémie, est envahi par les morts-vivants. Il rencontre dès son premier jour de sortie de l'hôpital Morgan et son fils Duane Jones qui lui expliquent la situation actuelle : la ville et peut être même les Etats-Unis tout entier sont ravagés et il n'existe apparemment plus aucune forme d'autorité. Il part très vite à la recherche de sa femme Lori et de son fils Carl, en laissant un talkie walkie à Morgan pour le joindre chaque jour et fait la connaissance d'un groupe de survivants composé d'Andrea et sa petite soeur Amy, Glenn Rhee, Dale Horvath, T-Dog, Jacqui, Jim, Morales ainsi que sa femme et ses deux enfants, Daryl Dixon et son grand frère instable Merle Dixon ainsi qu'Ed Peletier, sa femme Carol et leur fille Sophia, qui ont trouvé refuge et monté un camp dans les collines d'Atlanta. Il retrouve dans ce camp sa femme et son fils qui ont été sauvés par Shane Walsh, le meilleur ami de Rick, lors de l'épidémie. Shane lui même se trouve au camp et a couché avec Lori, cette dernière pensant Rick décédé. Lors du retour de Rick, Lori interdira à Shane de s'approcher d'elle et son fils, étant sûr que Shane lui a menti au sujet de Rick alors que Shane pensait ce dernier réellement mort. Le camps est attaqué une nuit par un groupe de nombreux rôdeurs qui réalise un véritable massacre, tuant Amy et Ed. Andrea sombre alors dans une grande détresse / dépression suite à la mort de sa sœur. Le lendemain de ce drame, Morales se sépare du groupe avec sa femme et ses enfants pour retrouver leur famille tandis que le reste du groupe s'en va pour le CDC d'Atlanta.
À leur arrivée, ils découvrent le Dr Edwin Jenner, seul, expliquant que la plupart des scientifiques a pris la fuite lors de l'épidémie ou a abandonné en se suicidant. Il leur en apprend aussi beaucoup plus sur la maladie, notamment que celle-ci peut prendre seulement trois minutes pour transformer une personne selon l'individu concerné. Que seul le tronc cérébral revient à la vie après la mort (ce qui leur permet de se déplacer) d'où le seul moyen pour en venir à bout : détruire le cerveau. Il leur révèle que, depuis tout ce temps, aucun remède n'a été trouvé et que le monde entier est anéanti par la maladie et pas seulement les Etats-Unis comme ils le pensaient. Alors qu'ils retrouvent un certain réconfort, notamment de l'eau, de la nourriture et même des douches, Shane alcoolisé tente de violer Lori qui parvient à le repousser et ne pas lui faire franchir les limites. Finalement, un compte à rebours est enclenché, compte à rebours qui, arrivé à zéro, enclenchera la destruction complète du CDC par une énorme explosion. Le groupe parvient à sortir mais Jacqui et Andrea préfèrent y rester pour mourir avec le Dr Jenner, n'étant pas prêtes à affronter l'extérieur. Juste avant l'évasion du groupe, le Dr Jenner chuchote quelque chose à l'oreille de Rick qui reste secret mais qui laisse le shérif bouche-bé.
L'explosion a lieu, tandis que Dale parvient à faire sortir Andrea in-extremis, détruisant intégralement le complexe. Le reste du groupe reprend finalement la route.
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